Celková výška finančných prostriedkov určená na podporu projektov v rámci tohto programu je 200 000 €.

Maximálna výška podpory na jeden projekt je 70 000 €. Povinnou prílohou je položkový rozpočet, v ktorom sú osobitne uvedené položky, na ktoré je požadovaný príspevok od EkoFondu.

Oprávnenými nákladmi, ktoré je možné zahrnúť do projektu, sú:

• náklady uvedené v realizačnej projektovej dokumentácii, vrátane nákladov na projektovú dokumentáciu.
• náklady, ktoré boli žiadateľovi schválené a ktoré mu vznikli v súvislosti s realizáciou projektu po podpise zmluvy oboma zmluvnými stranami
• najmä náklady na zakúpenie prístrojovej techniky, technológií, zrealizovanie stavebných úprav.

POUKÁZANIE FINANČNÝCH PROSTRIEDKOV NA ÚČET ŽIADATEĽA
Finančné prostriedky určené na aplikovaný výskum a vývoj budú žiadateľovi vyplatené  v minimálne troch splátkach:

1. splátka vo výške 30% schváleného príspevku budú vyplatené žiadateľovi po schválení projektu, podpise zmluvy a preukázaní zabezpečenia spolufinancovania projektu, resp. výskumnej úlohy.
2. splátka vo výške 50% bude naviazaná na priebežné plnenie obsahu projektu a bude podliehať schvaľovaniu zo strany EkoFondu.  
3. splátka vo výške 20% bude žiadateľovi vyplatených  po ukončení projektu, resp. výskumnej úlohy a predložení a schválení záverečnej správy projektu.

V prípade dlhodobých projektov má EkoFond právo rozdeliť na základe dohody s podporenou organizáciou splátky aj na viac častí.

OSTATNÉ PODMIENKY
V projekte je povinná finančná spoluúčasť žiadateľa vo výške minimálne 10 % na priamych projektových nákladoch. Do spoluúčasti je možné zahrnúť len náklady priamo súvisiace s projektom, odsúhlasené v rámci schvaľovania projektu. Náklady na spoluúčasť musia byť pri záverečnom vyhodnotení projektu zdokladované rovnako ako samotné projektové náklady. Príspevok na mzdové náklady súvisiace s projektom môže tvoriť maximálne 20% zo sumy poskytnutej EkoFondom.

Príjem z využitia výsledkov projektu môže byť použitý podporenou organizáciou len na verejnoprospešné účely. 

Poradný výbor má právo individuálne posúdiť výšku oprávnených nákladov projektu a má právo ich upraviť na štandardnú úroveň. Tento krok môže realizovať  výhradne pre potreby určenia a schválenia podpory jednotlivého projektu. O tomto kroku bude EkoFond informovať žiadateľa súčasne s oznámením výsledku schvaľovacieho procesu.